석사후 국책연구소는 무리 정도가 아니고, 불가능합니다.
물론 정규직 말이죠...
계약직으로는 갈수 있는데, 다음과 같은 경우를 만족해야 합니다.

- 지금 프로젝트 하시는거중에 가고자 하시는 국책연구소의 프로젝트를 수행하는게 있어야 하고,
- 해당 국책연구소 담당 팀의 연구가 마지막 진행년차가 아니어야 하고,
- 해당 국책연구소 담당 팀에 계약직 T/O가 1건 이상 존재해야 하며,
- 님이 실적을 잘 내서 나름 똘똘하다는 이미지로 비추어졌을때입니다.

그게 아니면 계약직 조차도 어려우며,
만약 계약직으로 간다 해도, 석사는 정규직 전환이 불가능합니다.
국책연구소를 꼭 가시려면 박사학위를 취득하셔야 하며,
박사학위를 취득한다고 해도 매우 낮은 확률로 국책연구소 입사가 가능합니다.
만약.. 석사인 경우에도... 한가지 가능성이야 있습니다.
연구실적이 넘쳐난다면요. SCI 1저자로 3-4편이상 있는 정도면 모르겠습니다.
SCI 1~2개 있는 석사는 많아서 희소성이 없구요.
그 정도가 아니면 그냥 포기하시구요, 그냥 회사 취업을 알아보시는것을 권유드립니다.